根据《东莞市轨道交通网络规划》，东莞轨道交通远期由4条线路构成，全长194.3 7公里，通过镇区21个，设立车站55座。
线路
R1线从麻涌到黄江南站，是一条西北－东南方向的直径线，全长59.4 4公里，其中汽车总站站到会展中心站及松山湖境内为地下线，长20.6 6公里，其余均为高架线38.7 8公里，途经麻涌镇、望牛墩镇、道滘镇、万江、南城、东城、大岭山镇、松山湖、黄江镇等9个镇区，设站13个。
R2线从石龙火车站西广场到长安镇振安一路，是一条由北部－西南方向的切线，全长59.9 1公里，其中学院路北站至省道S256段及虎门商贸城段为地下线，长16.2 2公里，其余为高架线，长43.69公里，途经石碣、石龙、茶山、东城、莞城、南城、厚街、和长安9个镇区，设站20个。
R3线从长安镇振安一路到谢岗，是一条西南－东部的切线，全长50.8 5公里，其中松山湖和常平境内部分路段为地下线，长19公里，其余为高架线，长31.8 5公里。途经长安、大岭山、松山湖、东坑、常平、谢岗6个镇区，设站14个。
R4线从R1线黄江站到康怡路清溪汽车总站，是市域东南部东西方向的一条切线，全线高架，途经黄江、塘厦、清溪，全长24.17公里，设站8个。
建设
东莞轨道交通建设规划将分近期和远期两阶段付诸实施。近期估算静态总投资为273.3亿元，动态总投资为295.4亿元。
近期项目将分三期建设实施：一期工程，R2线一期，石龙站-新城中心；二期工程，R2线二期，新城中心-长安汽车站；三期工程，包括R1线一期和R3线一期。
此外，远期首先建设R1线麻涌-新人民医院站和松山湖站-黄江南站，全长31.8 1公里，其次建设R3线东莞东站-谢岗东站、R4线黄江站-清溪汽车站，线路全长37.3 8公里。
东莞轨道交通建成后，根据规划中出行时间目标要求，以东莞市区为核心至常平、虎门的出行时间约为30分钟，至松山湖出行时间约为20分钟，R1、R2、R3线采用最高速度120公里/小时的车辆，可以满足出行时间要求。
列车
《东莞市轨道交通建设规划》显示，东莞轨道交通运行系统可选择普通轮轨系统、直线电机系统和低速磁悬浮系统，规划暂按采用普通轮轨系统、B型车考虑，初步选用最高时速为120公里的车辆。
R1、R2、R3线均为连接市域各功能片区的市域快速长大干线，R1线最大站间距为11.5公里，平均站间距为4.53公里；R3线最大站间距为6.67公里，平均站间距为3.87公里；R2线最大站间距为5.3公里，平均站间距为3.13公里；旅客在车上的旅行时间相对较长，为提高乘坐舒适度，在满足客流量要求的前提下，应适当降低车辆定员，以适应本线功能定位和客流特征。
R1、R2、R3线近远期车辆正常载客，站立定员采用5人/平方米标准，具体定员：带司机室车辆为180人/辆，不带司机室车辆为210人/辆。
对东莞的发展
未来东莞将形成“节点、片区”型的城镇空间结构，规划形成由具有区域意义的“四大专业中心：主城区、松山湖、虎门——厚街、常平——樟木头”形成复合型中心，共同承担区域与市域的服务职能，承担相应片区内部的综合服务职能。通过轨道交通的建设，将四大专业中心——主城区、松山湖、虎门——厚街、常平——樟木头紧密连接在一起，有助于缩短城区（莞城）与城市主要功能区以及主要功能区之间的空间距离。
这将改变东莞市自下而上、分散发展的格局，构建“自上而下”的政府主导发展模式，促进西北部片区、西南部片区、中部片区、东北部片区、东南部片区这五大片区的快速形成和发展，缩短片区时空距离，加快东莞产业重组和结构调整，实现城市发展目标。
城际轨道交通
东莞市轨道交通的功能定位有“外联”的作用，根据网线规划，R1线的功能定位为东莞至广州和深圳的快速联络线，通过麻涌镇接广州5号线蟹山站，通过黄江镇可接深圳4号线龙华站。R2线南部通过长安后，接深圳机场站，北部在石龙站预留与增城的接口。R3线在谢岗镇预留与惠州城市轨道交通的接口。
根据省铁路建设投资集团有限公司编制的《珠三角轨道交通网广州-东莞-深圳城际铁路可行性研究》，广州-东莞-深圳城际铁路在东莞境内线路走向与东莞市轨道交通R1线麻涌-会展中心站和R2线会展中心站-长安汽车站的线路走廊重合，其在东莞境内不仅承担城际轨道交通功能，还承担东莞市域轨道交通功能。
《东莞轨道交通建设规划》称，轨道交通建成后，东莞将通过城市轨道交通与区域交通枢纽的合理衔接，加强城市主要区域中心、主要城镇与珠三角的快速联系，承担对外交通的集散功能，通过在铁路石龙站、新东莞站、东莞东站这几处区域换乘枢纽与珠三角区域轨道交通衔接，增强与广州、深圳等周边城市的联系，使东莞更好地融入珠三角区域经济发展，连接相邻城市广州、深圳的城市轨道交通线路，满足东莞与两市之间相邻区域的交通需求，承担由于“同城效应”产生的区域客流。
线路
R1线从麻涌到黄江南站，是一条西北－东南方向的直径线，全长59.4 4公里，其中汽车总站站到会展中心站及松山湖境内为地下线，长20.6 6公里，其余均为高架线38.7 8公里，途经麻涌镇、望牛墩镇、道滘镇、万江、南城、东城、大岭山镇、松山湖、黄江镇等9个镇区，设站13个。
R2线从石龙火车站西广场到长安镇振安一路，是一条由北部－西南方向的切线，全长59.9 1公里，其中学院路北站至省道S256段及虎门商贸城段为地下线，长16.2 2公里，其余为高架线，长43.69公里，途经石碣、石龙、茶山、东城、莞城、南城、厚街、和长安9个镇区，设站20个。
R3线从长安镇振安一路到谢岗，是一条西南－东部的切线，全长50.8 5公里，其中松山湖和常平境内部分路段为地下线，长19公里，其余为高架线，长31.8 5公里。途经长安、大岭山、松山湖、东坑、常平、谢岗6个镇区，设站14个。
R4线从R1线黄江站到康怡路清溪汽车总站，是市域东南部东西方向的一条切线，全线高架，途经黄江、塘厦、清溪，全长24.17公里，设站8个。
建设
东莞轨道交通建设规划将分近期和远期两阶段付诸实施。近期估算静态总投资为273.3亿元，动态总投资为295.4亿元。
近期项目将分三期建设实施：一期工程，R2线一期，石龙站-新城中心；二期工程，R2线二期，新城中心-长安汽车站；三期工程，包括R1线一期和R3线一期。
此外，远期首先建设R1线麻涌-新人民医院站和松山湖站-黄江南站，全长31.8 1公里，其次建设R3线东莞东站-谢岗东站、R4线黄江站-清溪汽车站，线路全长37.3 8公里。
东莞轨道交通建成后，根据规划中出行时间目标要求，以东莞市区为核心至常平、虎门的出行时间约为30分钟，至松山湖出行时间约为20分钟，R1、R2、R3线采用最高速度120公里/小时的车辆，可以满足出行时间要求。
列车
《东莞市轨道交通建设规划》显示，东莞轨道交通运行系统可选择普通轮轨系统、直线电机系统和低速磁悬浮系统，规划暂按采用普通轮轨系统、B型车考虑，初步选用最高时速为120公里的车辆。
R1、R2、R3线均为连接市域各功能片区的市域快速长大干线，R1线最大站间距为11.5公里，平均站间距为4.53公里；R3线最大站间距为6.67公里，平均站间距为3.87公里；R2线最大站间距为5.3公里，平均站间距为3.13公里；旅客在车上的旅行时间相对较长，为提高乘坐舒适度，在满足客流量要求的前提下，应适当降低车辆定员，以适应本线功能定位和客流特征。
R1、R2、R3线近远期车辆正常载客，站立定员采用5人/平方米标准，具体定员：带司机室车辆为180人/辆，不带司机室车辆为210人/辆。
对东莞的发展
未来东莞将形成“节点、片区”型的城镇空间结构，规划形成由具有区域意义的“四大专业中心：主城区、松山湖、虎门——厚街、常平——樟木头”形成复合型中心，共同承担区域与市域的服务职能，承担相应片区内部的综合服务职能。通过轨道交通的建设，将四大专业中心——主城区、松山湖、虎门——厚街、常平——樟木头紧密连接在一起，有助于缩短城区（莞城）与城市主要功能区以及主要功能区之间的空间距离。
这将改变东莞市自下而上、分散发展的格局，构建“自上而下”的政府主导发展模式，促进西北部片区、西南部片区、中部片区、东北部片区、东南部片区这五大片区的快速形成和发展，缩短片区时空距离，加快东莞产业重组和结构调整，实现城市发展目标。
城际轨道交通
东莞市轨道交通的功能定位有“外联”的作用，根据网线规划，R1线的功能定位为东莞至广州和深圳的快速联络线，通过麻涌镇接广州5号线蟹山站，通过黄江镇可接深圳4号线龙华站。R2线南部通过长安后，接深圳机场站，北部在石龙站预留与增城的接口。R3线在谢岗镇预留与惠州城市轨道交通的接口。
根据省铁路建设投资集团有限公司编制的《珠三角轨道交通网广州-东莞-深圳城际铁路可行性研究》，广州-东莞-深圳城际铁路在东莞境内线路走向与东莞市轨道交通R1线麻涌-会展中心站和R2线会展中心站-长安汽车站的线路走廊重合，其在东莞境内不仅承担城际轨道交通功能，还承担东莞市域轨道交通功能。
《东莞轨道交通建设规划》称，轨道交通建成后，东莞将通过城市轨道交通与区域交通枢纽的合理衔接，加强城市主要区域中心、主要城镇与珠三角的快速联系，承担对外交通的集散功能，通过在铁路石龙站、新东莞站、东莞东站这几处区域换乘枢纽与珠三角区域轨道交通衔接，增强与广州、深圳等周边城市的联系，使东莞更好地融入珠三角区域经济发展，连接相邻城市广州、深圳的城市轨道交通线路，满足东莞与两市之间相邻区域的交通需求，承担由于“同城效应”产生的区域客流。
